Erretrobirus endogenoen detekzioa eta karakterizazioa behietan eta beste hainbat mamaliotan
- Begoña M. Jugo Director
Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea
Fecha de defensa: 17 June 2010
- Juan Antonio Marigómez Allende Chair
- Asier Fullaondo Elordui-Zapaterietxe Secretary
- Rafael Aldabe Committee member
- Arcadi Navarro Cuartiellas Committee member
- Damián Fermín de Andrés Cara Committee member
Type: Thesis
Abstract
En este trabajo se han analizado los retrovirus endógenos (ERV) detectados en los genomas de varios mamíferos mediante herramientas bionformáticas. Los ERVs son elementos genómicos de origen retroviral y han sido descritos en un amplio rango de genomas de vertebrados, sobre todo en mamíferos. Sin embargo el conocimiento sobre estos elementos es limitado y los análisis genómicos realizados se han circunscrito a primates y roedores. Así, se ha realizado la identificación de ERVs en vaca y yegua, que son representantes de dos taxones (Ruminantia y Equidae) cuyos ERVs no han sido analizados a nivel genómico. También se ha estudiado la dinámica evolutiva (su proliferación y la permisividad de cambios en su secuencia) de los ERVs de estas dos especies, y para poner los resultados en contexto, se han analizado también los ERVs de otras especies, tales como, humano, chimpancé, ratón, rata y perro. Por último, en el genoma bovino, se ha analizado la expresión de ERVs utilizando las bases de datos de ESTs y se han caracterizado los genes cercanos a los ERVs.